Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF4O43474 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF4O43474 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF4O43474 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF4O43474 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF4O43474 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF4O43474 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF4O43474 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF4O43474 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF4O43474 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF4O43474 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF4O43474 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF4O43474 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF4O43474 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF4O43474 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF4O43474 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF4O43474 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLF4O43474 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLF4O43474 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLF4O43474 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLF4O43474 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLF4O43474 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLF4O43474 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLF4O43474 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF4O43474 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF4O43474 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF4O43474 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF4O43474 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF4O43474 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF4O43474 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF4O43474 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF4O43474 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF4O43474 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLF4O43474 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLF4O43474 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLF4O43474 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLF4O43474 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLF4O43474 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF4O43474 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF4O43474 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF4O43474 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLF4O43474 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLF4O43474 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLF4O43474 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLF4O43474 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KLF4O43474 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KLF4O43474 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLF4O43474 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLF4O43474 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLF4O43474 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLF4O43474 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLF4O43474 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLF4O43474 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF4O43474 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF4O43474 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF4O43474 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF4O43474 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF4O43474 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF4O43474 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLF4O43474 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KLF4O43474 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLF4O43474 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLF4O43474 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLF4O43474 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLF4O43474 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLF4O43474 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF4O43474 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF4O43474 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF4O43474 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF4O43474 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF4O43474 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF4O43474 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF4O43474 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLF4O43474 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF4O43474 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF4O43474 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF4O43474 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF4O43474 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF4O43474 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLF4O43474 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLF4O43474 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLF4O43474 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF4O43474 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF4O43474 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF4O43474 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF4O43474 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF4O43474 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF4O43474 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF4O43474 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF4O43474 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF4O43474 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF4O43474 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF4O43474 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF4O43474 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF4O43474 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF4O43474 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF4O43474 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF4O43474 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF4O43474 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF4O43474 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.1 ms