Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRPF3O43395 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRPF3O43395 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRPF3O43395 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PRPF3O43395 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRPF3O43395 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF3O43395 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF3O43395 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF3O43395 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRPF3O43395 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF3O43395 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF3O43395 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF3O43395 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF3O43395 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRPF3O43395 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRPF3O43395 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRPF3O43395 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRPF3O43395 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRPF3O43395 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRPF3O43395 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRPF3O43395 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PRPF3O43395 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRPF3O43395 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PRPF3O43395 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRPF3O43395 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PRPF3O43395 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRPF3O43395 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRPF3O43395 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRPF3O43395 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRPF3O43395 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRPF3O43395 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF3O43395 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF3O43395 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF3O43395 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF3O43395 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF3O43395 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF3O43395 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF3O43395 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF3O43395 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF3O43395 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRPF3O43395 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRPF3O43395 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRPF3O43395 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPF3O43395 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPF3O43395 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF3O43395 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms