Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC7A4O43246 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC7A4O43246 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC7A4O43246 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC7A4O43246 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms