Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PJA2O43164 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PJA2O43164 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PJA2O43164 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PJA2O43164 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PJA2O43164 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PJA2O43164 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PJA2O43164 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PJA2O43164 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PJA2O43164 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PJA2O43164 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PJA2O43164 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PJA2O43164 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PJA2O43164 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PJA2O43164 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PJA2O43164 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PJA2O43164 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PJA2O43164 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PJA2O43164 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PJA2O43164 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PJA2O43164 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PJA2O43164 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PJA2O43164 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PJA2O43164 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PJA2O43164 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PJA2O43164 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PJA2O43164 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PJA2O43164 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PJA2O43164 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PJA2O43164 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PJA2O43164 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PJA2O43164 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PJA2O43164 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PJA2O43164 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PJA2O43164 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PJA2O43164 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PJA2O43164 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PJA2O43164 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PJA2O43164 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PJA2O43164 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PJA2O43164 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PJA2O43164 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PJA2O43164 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PJA2O43164 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PJA2O43164 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PJA2O43164 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PJA2O43164 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PJA2O43164 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PJA2O43164 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PJA2O43164 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PJA2O43164 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PJA2O43164 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PJA2O43164 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PJA2O43164 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PJA2O43164 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PJA2O43164 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PJA2O43164 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PJA2O43164 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PJA2O43164 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PJA2O43164 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PJA2O43164 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PJA2O43164 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PJA2O43164 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PJA2O43164 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PJA2O43164 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PJA2O43164 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PJA2O43164 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PJA2O43164 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PJA2O43164 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PJA2O43164 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PJA2O43164 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PJA2O43164 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PJA2O43164 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PJA2O43164 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PJA2O43164 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PJA2O43164 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PJA2O43164 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PJA2O43164 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PJA2O43164 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PJA2O43164 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PJA2O43164 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PJA2O43164 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PJA2O43164 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PJA2O43164 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PJA2O43164 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PJA2O43164 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PJA2O43164 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PJA2O43164 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PJA2O43164 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PJA2O43164 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PJA2O43164 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PJA2O43164 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PJA2O43164 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PJA2O43164 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PJA2O43164 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PJA2O43164 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PJA2O43164 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PJA2O43164 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PJA2O43164 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PJA2O43164 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms