Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
FANCAO15360 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
FANCAO15360 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
FANCAO15360 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
FANCAO15360 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
FANCAO15360 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
FANCAO15360 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
FANCAO15360 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
FANCAO15360 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
FANCAO15360 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
FANCAO15360 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
FANCAO15360 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
FANCAO15360 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
FANCAO15360 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
FANCAO15360 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
FANCAO15360 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
FANCAO15360 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
FANCAO15360 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
FANCAO15360 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
FANCAO15360 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
FANCAO15360 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
FANCAO15360 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
FANCAO15360 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
FANCAO15360 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
FANCAO15360 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
FANCAO15360 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
FANCAO15360 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.72
FANCAO15360 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
FANCAO15360 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
FANCAO15360 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
FANCAO15360 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
FANCAO15360 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
FANCAO15360 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
FANCAO15360 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
FANCAO15360 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC38.28■■■■□ 3.72
FANCAO15360 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
FANCAO15360 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
FANCAO15360 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
FANCAO15360 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
FANCAO15360 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
FANCAO15360 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
FANCAO15360 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
FANCAO15360 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
FANCAO15360 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
FANCAO15360 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
FANCAO15360 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
FANCAO15360 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
FANCAO15360 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
FANCAO15360 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC38.24■■■■□ 3.71
FANCAO15360 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
FANCAO15360 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
FANCAO15360 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
FANCAO15360 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
FANCAO15360 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
FANCAO15360 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
FANCAO15360 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
FANCAO15360 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
FANCAO15360 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
FANCAO15360 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
FANCAO15360 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
FANCAO15360 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
FANCAO15360 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
FANCAO15360 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
FANCAO15360 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
FANCAO15360 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
FANCAO15360 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
FANCAO15360 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
FANCAO15360 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
FANCAO15360 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
FANCAO15360 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
FANCAO15360 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
FANCAO15360 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
FANCAO15360 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
FANCAO15360 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
FANCAO15360 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC38.16■■■■□ 3.7
FANCAO15360 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
FANCAO15360 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
FANCAO15360 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
FANCAO15360 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
FANCAO15360 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC38.13■■■■□ 3.69
FANCAO15360 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
FANCAO15360 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
FANCAO15360 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
FANCAO15360 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
FANCAO15360 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
FANCAO15360 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
FANCAO15360 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
FANCAO15360 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
FANCAO15360 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
FANCAO15360 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
FANCAO15360 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
FANCAO15360 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
FANCAO15360 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
FANCAO15360 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
FANCAO15360 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
FANCAO15360 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
FANCAO15360 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
FANCAO15360 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
FANCAO15360 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
FANCAO15360 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms