Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBDO15205 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBDO15205 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBDO15205 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBDO15205 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBDO15205 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBDO15205 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBDO15205 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBDO15205 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBDO15205 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBDO15205 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBDO15205 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBDO15205 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBDO15205 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBDO15205 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UBDO15205 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBDO15205 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBDO15205 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBDO15205 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
UBDO15205 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBDO15205 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
UBDO15205 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBDO15205 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBDO15205 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBDO15205 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBDO15205 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBDO15205 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBDO15205 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
UBDO15205 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBDO15205 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBDO15205 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBDO15205 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBDO15205 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBDO15205 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBDO15205 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBDO15205 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBDO15205 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBDO15205 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBDO15205 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBDO15205 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBDO15205 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBDO15205 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBDO15205 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBDO15205 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBDO15205 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBDO15205 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBDO15205 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBDO15205 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBDO15205 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBDO15205 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBDO15205 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBDO15205 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBDO15205 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBDO15205 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBDO15205 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBDO15205 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UBDO15205 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBDO15205 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBDO15205 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBDO15205 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBDO15205 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBDO15205 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBDO15205 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBDO15205 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UBDO15205 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBDO15205 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBDO15205 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBDO15205 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBDO15205 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBDO15205 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBDO15205 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBDO15205 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBDO15205 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBDO15205 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBDO15205 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBDO15205 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBDO15205 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBDO15205 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBDO15205 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBDO15205 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBDO15205 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBDO15205 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBDO15205 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBDO15205 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBDO15205 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBDO15205 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBDO15205 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBDO15205 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBDO15205 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBDO15205 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBDO15205 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBDO15205 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBDO15205 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBDO15205 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBDO15205 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBDO15205 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBDO15205 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBDO15205 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBDO15205 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBDO15205 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms