Protein–RNA interactions for Protein: O15118

NPC1, Niemann-Pick C1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1O15118 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1O15118 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1O15118 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1O15118 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1O15118 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1O15118 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1O15118 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1O15118 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1O15118 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1O15118 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1O15118 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPC1O15118 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPC1O15118 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NPC1O15118 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1O15118 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1O15118 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1O15118 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1O15118 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1O15118 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1O15118 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1O15118 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1O15118 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1O15118 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPC1O15118 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPC1O15118 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPC1O15118 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPC1O15118 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPC1O15118 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPC1O15118 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPC1O15118 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPC1O15118 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPC1O15118 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPC1O15118 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPC1O15118 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPC1O15118 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPC1O15118 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1O15118 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1O15118 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1O15118 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPC1O15118 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPC1O15118 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NPC1O15118 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPC1O15118 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPC1O15118 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPC1O15118 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPC1O15118 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NPC1O15118 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPC1O15118 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPC1O15118 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPC1O15118 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPC1O15118 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPC1O15118 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPC1O15118 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPC1O15118 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPC1O15118 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPC1O15118 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPC1O15118 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPC1O15118 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPC1O15118 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPC1O15118 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPC1O15118 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPC1O15118 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPC1O15118 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPC1O15118 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPC1O15118 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPC1O15118 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NPC1O15118 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPC1O15118 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPC1O15118 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPC1O15118 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NPC1O15118 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NPC1O15118 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPC1O15118 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPC1O15118 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPC1O15118 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1O15118 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1O15118 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1O15118 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1O15118 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1O15118 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPC1O15118 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1O15118 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1O15118 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1O15118 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1O15118 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPC1O15118 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPC1O15118 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPC1O15118 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPC1O15118 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPC1O15118 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPC1O15118 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPC1O15118 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPC1O15118 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPC1O15118 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPC1O15118 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPC1O15118 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPC1O15118 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NPC1O15118 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPC1O15118 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NPC1O15118 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms