Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHUKO15111 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHUKO15111 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHUKO15111 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHUKO15111 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHUKO15111 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHUKO15111 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHUKO15111 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHUKO15111 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHUKO15111 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHUKO15111 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHUKO15111 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHUKO15111 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHUKO15111 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CHUKO15111 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHUKO15111 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CHUKO15111 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHUKO15111 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHUKO15111 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHUKO15111 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHUKO15111 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHUKO15111 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CHUKO15111 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHUKO15111 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHUKO15111 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHUKO15111 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHUKO15111 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHUKO15111 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHUKO15111 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHUKO15111 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHUKO15111 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHUKO15111 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHUKO15111 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHUKO15111 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHUKO15111 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHUKO15111 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHUKO15111 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHUKO15111 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHUKO15111 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHUKO15111 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHUKO15111 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHUKO15111 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHUKO15111 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHUKO15111 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHUKO15111 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHUKO15111 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHUKO15111 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHUKO15111 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHUKO15111 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHUKO15111 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHUKO15111 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHUKO15111 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHUKO15111 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHUKO15111 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHUKO15111 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHUKO15111 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHUKO15111 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHUKO15111 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHUKO15111 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHUKO15111 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHUKO15111 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHUKO15111 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHUKO15111 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHUKO15111 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHUKO15111 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHUKO15111 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHUKO15111 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHUKO15111 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHUKO15111 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHUKO15111 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHUKO15111 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHUKO15111 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHUKO15111 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHUKO15111 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHUKO15111 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHUKO15111 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHUKO15111 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHUKO15111 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHUKO15111 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHUKO15111 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHUKO15111 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHUKO15111 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHUKO15111 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHUKO15111 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHUKO15111 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHUKO15111 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHUKO15111 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHUKO15111 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHUKO15111 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHUKO15111 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHUKO15111 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHUKO15111 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHUKO15111 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHUKO15111 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHUKO15111 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHUKO15111 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHUKO15111 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHUKO15111 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHUKO15111 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHUKO15111 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms