Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNPHO15079 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNPHO15079 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNPHO15079 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SNPHO15079 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNPHO15079 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNPHO15079 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNPHO15079 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNPHO15079 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNPHO15079 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNPHO15079 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNPHO15079 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNPHO15079 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SNPHO15079 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNPHO15079 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNPHO15079 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SNPHO15079 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNPHO15079 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNPHO15079 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNPHO15079 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNPHO15079 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNPHO15079 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNPHO15079 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNPHO15079 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNPHO15079 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNPHO15079 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNPHO15079 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNPHO15079 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNPHO15079 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNPHO15079 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNPHO15079 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNPHO15079 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNPHO15079 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNPHO15079 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNPHO15079 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNPHO15079 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNPHO15079 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNPHO15079 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNPHO15079 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNPHO15079 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNPHO15079 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNPHO15079 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNPHO15079 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNPHO15079 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNPHO15079 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNPHO15079 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNPHO15079 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNPHO15079 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNPHO15079 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNPHO15079 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNPHO15079 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNPHO15079 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNPHO15079 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNPHO15079 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNPHO15079 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNPHO15079 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNPHO15079 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNPHO15079 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNPHO15079 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNPHO15079 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNPHO15079 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNPHO15079 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNPHO15079 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNPHO15079 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNPHO15079 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNPHO15079 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNPHO15079 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNPHO15079 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNPHO15079 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNPHO15079 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNPHO15079 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNPHO15079 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNPHO15079 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNPHO15079 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNPHO15079 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNPHO15079 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNPHO15079 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNPHO15079 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNPHO15079 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNPHO15079 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNPHO15079 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNPHO15079 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNPHO15079 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNPHO15079 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNPHO15079 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNPHO15079 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNPHO15079 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNPHO15079 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNPHO15079 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNPHO15079 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNPHO15079 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNPHO15079 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNPHO15079 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNPHO15079 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNPHO15079 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNPHO15079 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNPHO15079 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNPHO15079 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNPHO15079 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNPHO15079 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms