Protein–RNA interactions for Protein: O00626

CCL22, C-C motif chemokine 22, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL22O00626 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL22O00626 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL22O00626 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL22O00626 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL22O00626 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL22O00626 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL22O00626 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL22O00626 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCL22O00626 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL22O00626 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL22O00626 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL22O00626 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL22O00626 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL22O00626 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL22O00626 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL22O00626 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL22O00626 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL22O00626 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL22O00626 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL22O00626 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL22O00626 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL22O00626 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL22O00626 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL22O00626 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL22O00626 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL22O00626 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL22O00626 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL22O00626 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL22O00626 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL22O00626 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL22O00626 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL22O00626 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL22O00626 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL22O00626 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL22O00626 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL22O00626 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL22O00626 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL22O00626 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL22O00626 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL22O00626 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL22O00626 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL22O00626 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL22O00626 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL22O00626 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL22O00626 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL22O00626 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL22O00626 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL22O00626 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL22O00626 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL22O00626 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL22O00626 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL22O00626 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL22O00626 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL22O00626 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL22O00626 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL22O00626 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL22O00626 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL22O00626 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL22O00626 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL22O00626 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL22O00626 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL22O00626 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL22O00626 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL22O00626 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL22O00626 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL22O00626 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL22O00626 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL22O00626 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL22O00626 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCL22O00626 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCL22O00626 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL22O00626 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL22O00626 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL22O00626 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL22O00626 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL22O00626 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL22O00626 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL22O00626 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL22O00626 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCL22O00626 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL22O00626 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL22O00626 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL22O00626 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL22O00626 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL22O00626 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL22O00626 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL22O00626 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL22O00626 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL22O00626 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL22O00626 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL22O00626 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL22O00626 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL22O00626 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL22O00626 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL22O00626 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL22O00626 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL22O00626 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL22O00626 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL22O00626 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCL22O00626 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms