Protein–RNA interactions for Protein: O00469

PLOD2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD2O00469 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLOD2O00469 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLOD2O00469 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLOD2O00469 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLOD2O00469 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLOD2O00469 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLOD2O00469 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLOD2O00469 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLOD2O00469 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLOD2O00469 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLOD2O00469 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLOD2O00469 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLOD2O00469 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLOD2O00469 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLOD2O00469 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLOD2O00469 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLOD2O00469 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLOD2O00469 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLOD2O00469 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLOD2O00469 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLOD2O00469 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLOD2O00469 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PLOD2O00469 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLOD2O00469 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLOD2O00469 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLOD2O00469 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLOD2O00469 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLOD2O00469 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLOD2O00469 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLOD2O00469 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLOD2O00469 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLOD2O00469 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLOD2O00469 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLOD2O00469 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLOD2O00469 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 264.3 ms