Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE2AO00408 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE2AO00408 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE2AO00408 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE2AO00408 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE2AO00408 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE2AO00408 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE2AO00408 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE2AO00408 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE2AO00408 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE2AO00408 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE2AO00408 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE2AO00408 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE2AO00408 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE2AO00408 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE2AO00408 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE2AO00408 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE2AO00408 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE2AO00408 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE2AO00408 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE2AO00408 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE2AO00408 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE2AO00408 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE2AO00408 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE2AO00408 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE2AO00408 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE2AO00408 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE2AO00408 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE2AO00408 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE2AO00408 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE2AO00408 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE2AO00408 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE2AO00408 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE2AO00408 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE2AO00408 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE2AO00408 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE2AO00408 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE2AO00408 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE2AO00408 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE2AO00408 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE2AO00408 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms