Protein–RNA interactions for Protein: O00255

MEN1, Menin, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEN1O00255 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MEN1O00255 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEN1O00255 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEN1O00255 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEN1O00255 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEN1O00255 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEN1O00255 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEN1O00255 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEN1O00255 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEN1O00255 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MEN1O00255 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEN1O00255 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MEN1O00255 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEN1O00255 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEN1O00255 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEN1O00255 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEN1O00255 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEN1O00255 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEN1O00255 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEN1O00255 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MEN1O00255 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEN1O00255 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEN1O00255 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEN1O00255 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEN1O00255 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEN1O00255 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEN1O00255 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEN1O00255 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEN1O00255 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MEN1O00255 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MEN1O00255 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEN1O00255 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEN1O00255 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEN1O00255 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEN1O00255 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEN1O00255 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEN1O00255 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEN1O00255 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEN1O00255 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEN1O00255 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEN1O00255 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MEN1O00255 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MEN1O00255 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEN1O00255 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEN1O00255 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEN1O00255 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEN1O00255 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEN1O00255 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEN1O00255 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEN1O00255 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEN1O00255 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEN1O00255 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEN1O00255 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEN1O00255 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEN1O00255 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEN1O00255 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MEN1O00255 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MEN1O00255 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEN1O00255 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MEN1O00255 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEN1O00255 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEN1O00255 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEN1O00255 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEN1O00255 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEN1O00255 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MEN1O00255 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEN1O00255 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEN1O00255 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEN1O00255 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEN1O00255 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEN1O00255 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEN1O00255 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEN1O00255 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEN1O00255 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEN1O00255 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEN1O00255 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEN1O00255 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEN1O00255 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEN1O00255 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MEN1O00255 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEN1O00255 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEN1O00255 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEN1O00255 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEN1O00255 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEN1O00255 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEN1O00255 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEN1O00255 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEN1O00255 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEN1O00255 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEN1O00255 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEN1O00255 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MEN1O00255 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MEN1O00255 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEN1O00255 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEN1O00255 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEN1O00255 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEN1O00255 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEN1O00255 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEN1O00255 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MEN1O00255 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms