Protein–RNA interactions for Protein: O00206

TLR4, Toll-like receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR4O00206 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLR4O00206 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLR4O00206 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLR4O00206 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLR4O00206 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLR4O00206 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR4O00206 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR4O00206 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR4O00206 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR4O00206 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR4O00206 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLR4O00206 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLR4O00206 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLR4O00206 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR4O00206 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR4O00206 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR4O00206 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR4O00206 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR4O00206 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR4O00206 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR4O00206 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR4O00206 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR4O00206 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TLR4O00206 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR4O00206 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR4O00206 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR4O00206 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR4O00206 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR4O00206 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR4O00206 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR4O00206 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR4O00206 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR4O00206 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR4O00206 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR4O00206 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLR4O00206 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLR4O00206 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLR4O00206 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TLR4O00206 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLR4O00206 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLR4O00206 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR4O00206 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR4O00206 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR4O00206 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR4O00206 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR4O00206 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR4O00206 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR4O00206 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR4O00206 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR4O00206 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR4O00206 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR4O00206 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR4O00206 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR4O00206 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR4O00206 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLR4O00206 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLR4O00206 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLR4O00206 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TLR4O00206 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLR4O00206 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR4O00206 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR4O00206 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR4O00206 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR4O00206 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR4O00206 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR4O00206 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR4O00206 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR4O00206 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR4O00206 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLR4O00206 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLR4O00206 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLR4O00206 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLR4O00206 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR4O00206 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR4O00206 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR4O00206 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR4O00206 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TLR4O00206 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR4O00206 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR4O00206 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR4O00206 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR4O00206 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR4O00206 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR4O00206 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR4O00206 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR4O00206 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR4O00206 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR4O00206 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR4O00206 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR4O00206 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR4O00206 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR4O00206 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR4O00206 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR4O00206 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR4O00206 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR4O00206 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR4O00206 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR4O00206 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR4O00206 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR4O00206 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms