Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B4DXG7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B4DXG7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B4DXG7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B4DXG7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B4DXG7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B4DXG7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
B4DXG7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
B4DXG7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
B4DXG7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
B4DXG7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
B4DXG7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
B4DXG7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
B4DXG7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
B4DXG7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B4DXG7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B4DXG7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
B4DXG7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B4DXG7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
B4DXG7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B4DXG7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B4DXG7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B4DXG7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
B4DXG7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B4DXG7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B4DXG7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B4DXG7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B4DXG7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B4DXG7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B4DXG7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
B4DXG7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
B4DXG7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
B4DXG7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B4DXG7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
B4DXG7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B4DXG7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B4DXG7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B4DXG7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
B4DXG7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B4DXG7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
B4DXG7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B4DXG7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B4DXG7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
B4DXG7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B4DXG7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
B4DXG7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
B4DXG7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
B4DXG7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B4DXG7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B4DXG7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B4DXG7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B4DXG7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B4DXG7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B4DXG7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B4DXG7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B4DXG7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B4DXG7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B4DXG7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B4DXG7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B4DXG7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B4DXG7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B4DXG7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B4DXG7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4DXG7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4DXG7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4DXG7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B4DXG7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B4DXG7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B4DXG7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B4DXG7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B4DXG7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B4DXG7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B4DXG7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B4DXG7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B4DXG7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
B4DXG7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B4DXG7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
B4DXG7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
B4DXG7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B4DXG7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B4DXG7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B4DXG7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B4DXG7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B4DXG7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B4DXG7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B4DXG7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B4DXG7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B4DXG7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B4DXG7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B4DXG7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B4DXG7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B4DXG7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B4DXG7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B4DXG7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
B4DXG7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
B4DXG7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B4DXG7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B4DXG7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B4DXG7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B4DXG7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms