Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PALM2-AKAP2B1ALY0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PALM2-AKAP2B1ALY0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
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