Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN0

OTOL1, Otolin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOL1A6NHN0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OTOL1A6NHN0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOL1A6NHN0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOL1A6NHN0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOL1A6NHN0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOL1A6NHN0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OTOL1A6NHN0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOL1A6NHN0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOL1A6NHN0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOL1A6NHN0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOL1A6NHN0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOL1A6NHN0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOL1A6NHN0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTOL1A6NHN0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTOL1A6NHN0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTOL1A6NHN0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTOL1A6NHN0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTOL1A6NHN0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTOL1A6NHN0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOL1A6NHN0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
OTOL1A6NHN0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOL1A6NHN0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms