Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN8A6NHC0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN8A6NHC0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN8A6NHC0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN8A6NHC0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms