Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU0

FAM187A, Ig-like V-type domain-containing protein FAM187A, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187AA6NFU0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM187AA6NFU0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
FAM187AA6NFU0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM187AA6NFU0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM187AA6NFU0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FAM187AA6NFU0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM187AA6NFU0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM187AA6NFU0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM187AA6NFU0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM187AA6NFU0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM187AA6NFU0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms