Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A6NDN8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A6NDN8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A6NDN8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A6NDN8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A6NDN8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A6NDN8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A6NDN8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A6NDN8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A6NDN8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A6NDN8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A6NDN8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A6NDN8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A6NDN8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A6NDN8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
A6NDN8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A6NDN8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A6NDN8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A6NDN8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A6NDN8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A6NDN8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A6NDN8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A6NDN8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A6NDN8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
A6NDN8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
A6NDN8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A6NDN8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A6NDN8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
A6NDN8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A6NDN8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
A6NDN8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
A6NDN8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A6NDN8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A6NDN8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A6NDN8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A6NDN8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A6NDN8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A6NDN8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
A6NDN8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A6NDN8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NDN8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NDN8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NDN8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NDN8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NDN8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NDN8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NDN8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NDN8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NDN8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NDN8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NDN8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NDN8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NDN8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NDN8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NDN8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NDN8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NDN8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NDN8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NDN8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
A6NDN8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A6NDN8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A6NDN8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A6NDN8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
A6NDN8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A6NDN8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
A6NDN8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A6NDN8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A6NDN8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A6NDN8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A6NDN8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A6NDN8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A6NDN8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A6NDN8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A6NDN8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A6NDN8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A6NDN8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A6NDN8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NDN8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NDN8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NDN8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NDN8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A6NDN8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NDN8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NDN8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NDN8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NDN8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A6NDN8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NDN8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NDN8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NDN8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NDN8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NDN8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NDN8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NDN8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NDN8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NDN8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NDN8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A6NDN8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A6NDN8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A6NDN8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms