Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYNDIG1LA6NDD5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNDIG1LA6NDD5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms