Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC78A2IDD5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC78A2IDD5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC78A2IDD5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms