Protein–RNA interactions for Protein: A1X283

SH3PXD2B, SH3 and PX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3PXD2BA1X283 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3PXD2BA1X283 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3PXD2BA1X283 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3PXD2BA1X283 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms