Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
E2F8A0AVK6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
E2F8A0AVK6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E2F8A0AVK6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms