Protein–RNA interactions for Protein: A0AV96

RBM47, RNA-binding protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM47A0AV96 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RBM47A0AV96 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RBM47A0AV96 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RBM47A0AV96 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM47A0AV96 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM47A0AV96 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM47A0AV96 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM47A0AV96 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM47A0AV96 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM47A0AV96 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM47A0AV96 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM47A0AV96 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM47A0AV96 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM47A0AV96 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM47A0AV96 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM47A0AV96 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM47A0AV96 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM47A0AV96 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM47A0AV96 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM47A0AV96 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM47A0AV96 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM47A0AV96 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RBM47A0AV96 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RBM47A0AV96 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM47A0AV96 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms