Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP16Q9Y5T5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms