Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms