Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED7Q9Y3B3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMED7Q9Y3B3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms