Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC8Q9Y2L5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms