Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBNO2Q9Y2G9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SBNO2Q9Y2G9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms