Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVW-1Q9UQF0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms