Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SHANK2Q9UPX8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms