Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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