Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD1Q9UIS9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms