Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms