Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1BQ9UD71 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1BQ9UD71 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms