Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DUX4Q9UBX2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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