Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms