Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms