Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP2BPQ9P2M1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRP2BPQ9P2M1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms