Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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