Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVK13-1Q9NX77 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms