Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COMMD8Q9NX08 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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