Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC4Q9NTJ3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms