Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TREX1Q9NSU2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms