Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBQLN4Q9NRR5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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