Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH2B1Q9NRF2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms