Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CHST12Q9NRB3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms