Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-220ENST00000580560 564 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.691e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 LMBR1L-213ENST00000549730 585 ntTSL 510.56□□□□□ -0.721e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 IMMP1L-209ENST00000532287 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.743e-10■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 GNE-206ENST00000543356 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP17-218ENST00000575656 978 ntTSL 39.98□□□□□ -0.811e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL1-203ENST00000518298 921 ntTSL 1 (best)9.98□□□□□ -0.814e-6■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 ATP6V1E1-206ENST00000473248 832 ntTSL 29.88□□□□□ -0.831e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 SCRN3-201ENST00000272732 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.841e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 NSUN3-207ENST00000485793 816 ntTSL 39.63□□□□□ -0.871e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 PHKG2-203ENST00000561712 621 ntTSL 39.47□□□□□ -0.891e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 C17orf62-236ENST00000584891 468 ntTSL 38.05□□□□□ -1.121e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.153e-7■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 NSUN3-203ENST00000468555 571 ntTSL 47.88□□□□□ -1.151e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 TGIF1-213ENST00000549468 526 ntTSL 37.73□□□□□ -1.171e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 NSUN3-204ENST00000476588 1535 ntTSL 27.73□□□□□ -1.171e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 NSUN3-206ENST00000483378 582 ntTSL 47.34□□□□□ -1.231e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 IMMP1L-208ENST00000531693 437 ntTSL 27.28□□□□□ -1.243e-10■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 LARP1-207ENST00000518742 587 ntTSL 57.24□□□□□ -1.251e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.331e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.441e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 TGIF1-217ENST00000551333 564 ntTSL 35.51□□□□□ -1.531e-18■■■■■ 161.5
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-222ENST00000589070 582 ntTSL 319.56■□□□□ 0.727e-7■■■■■ 161.2
UTP3Q9NQZ2 MAEA-218ENST00000513301 595 ntTSL 417.91■□□□□ 0.465e-7■■■■■ 161.2
UTP3Q9NQZ2 MAEA-216ENST00000512308 839 ntTSL 517.83■□□□□ 0.445e-7■■■■■ 161.2
UTP3Q9NQZ2 SMC1A-203ENST00000428014 868 ntTSL 39.61□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 161.1
UTP3Q9NQZ2 ITPR1-218ENST00000494681 580 ntTSL 415.14■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 161.1
UTP3Q9NQZ2 LDAH-205ENST00000412261 566 ntTSL 414.9□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 161.1
UTP3Q9NQZ2 LDAH-204ENST00000403006 1895 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 161.1
UTP3Q9NQZ2 LDAH-207ENST00000432947 548 ntTSL 412.77□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 161.1
UTP3Q9NQZ2 LDAH-213ENST00000626491 1179 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 161.1
UTP3Q9NQZ2 LDAH-202ENST00000381090 2045 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 161.1
UTP3Q9NQZ2 MEIS1-212ENST00000495021 2836 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.571e-11■■■■■ 161.1
UTP3Q9NQZ2 MEIS1-214ENST00000498705 532 ntTSL 510.33□□□□□ -0.761e-11■■■■■ 161.1
UTP3Q9NQZ2 MEIS1-217ENST00000606455 564 ntTSL 410.11□□□□□ -0.791e-11■■■■■ 161.1
UTP3Q9NQZ2 MEIS1-204ENST00000409622 551 ntTSL 410.11□□□□□ -0.791e-11■■■■■ 161.1
UTP3Q9NQZ2 MEIS1-216ENST00000560281 2773 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.81e-11■■■■■ 161.1
UTP3Q9NQZ2 MEIS1-202ENST00000398506 3530 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.851e-11■■■■■ 161.1
UTP3Q9NQZ2 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.981e-11■■■■■ 161.1
UTP3Q9NQZ2 LDAH-201ENST00000237822 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 161.1
UTP3Q9NQZ2 LDAH-208ENST00000435420 3837 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 161.1
UTP3Q9NQZ2 LDAH-209ENST00000440866 3728 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.061e-6■■■■■ 161.1
UTP3Q9NQZ2 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.181e-11■■■■■ 161.1
UTP3Q9NQZ2 MEIS1-208ENST00000475239 573 ntTSL 37.37□□□□□ -1.231e-11■■■■■ 161.1
UTP3Q9NQZ2 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.391e-6■■■■■ 161.1
UTP3Q9NQZ2 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.491e-6■■■■■ 161.1
UTP3Q9NQZ2 MYO18A-222ENST00000590565 261 ntTSL 34.29□□□□□ -1.721e-6■■■■■ 161.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.732e-7■■■■■ 161
UTP3Q9NQZ2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 161
UTP3Q9NQZ2 PTGES3L-AARSD1-205ENST00000423601 584 ntTSL 315.72■□□□□ 0.111e-29■■■■■ 161
UTP3Q9NQZ2 AARSD1-210ENST00000483774 928 ntTSL 1 (best)14.34□□□□□ -0.111e-29■■■■■ 161
UTP3Q9NQZ2 AARSD1-217ENST00000591910 726 ntTSL 313.84□□□□□ -0.191e-29■■■■■ 161
UTP3Q9NQZ2 AARSD1-213ENST00000491665 762 ntTSL 213.54□□□□□ -0.241e-29■■■■■ 161
UTP3Q9NQZ2 AARSD1-205ENST00000441280 983 ntTSL 212.95□□□□□ -0.341e-29■■■■■ 161
UTP3Q9NQZ2 AARSD1-212ENST00000486664 648 ntTSL 312.88□□□□□ -0.351e-29■■■■■ 161
UTP3Q9NQZ2 AARSD1-203ENST00000430739 752 ntTSL 312.84□□□□□ -0.351e-29■■■■■ 161
UTP3Q9NQZ2 AARSD1-206ENST00000450475 783 ntTSL 512.6□□□□□ -0.391e-29■■■■■ 161
UTP3Q9NQZ2 AARSD1-208ENST00000478040 561 ntTSL 29.16□□□□□ -0.941e-29■■■■■ 161
UTP3Q9NQZ2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.445e-7■■■■■ 161
UTP3Q9NQZ2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.295e-7■■■■■ 161
UTP3Q9NQZ2 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 161
UTP3Q9NQZ2 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 160.9
UTP3Q9NQZ2 EXOSC10-201ENST00000304457 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.664e-13■■■■■ 160.9
UTP3Q9NQZ2 EXOSC10-202ENST00000376936 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.734e-13■■■■■ 160.9
UTP3Q9NQZ2 HDGFL2-207ENST00000615225 3100 ntTSL 519.61■□□□□ 0.735e-11■■■■■ 160.8
UTP3Q9NQZ2 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 160.8
UTP3Q9NQZ2 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 160.8
UTP3Q9NQZ2 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.174e-7■■■■■ 160.8
UTP3Q9NQZ2 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 160.8
UTP3Q9NQZ2 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 160.8
UTP3Q9NQZ2 SERPINB1-205ENST00000490094 782 ntTSL 519.04■□□□□ 0.641e-11■■■■■ 160.8
UTP3Q9NQZ2 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.131e-11■■■■■ 160.8
UTP3Q9NQZ2 PFKP-212ENST00000607886 432 ntTSL 514.31□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 160.8
UTP3Q9NQZ2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.382e-6■■■■■ 160.8
UTP3Q9NQZ2 USP36-214ENST00000589225 5885 ntTSL 1 (best)16.99■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 160.8
UTP3Q9NQZ2 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 160.8
UTP3Q9NQZ2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.016e-8■■■■■ 160.7
UTP3Q9NQZ2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.665e-7■■■■■ 160.7
UTP3Q9NQZ2 CLK3-206ENST00000562078 2455 ntTSL 214.08□□□□□ -0.163e-8■■■■■ 160.7
UTP3Q9NQZ2 TRPS1-201ENST00000220888 5480 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 160.6
UTP3Q9NQZ2 TRPS1-211ENST00000520276 4083 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.731e-6■■■■■ 160.6
UTP3Q9NQZ2 TRPS1-212ENST00000640765 9514 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 160.6
UTP3Q9NQZ2 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 160.6
UTP3Q9NQZ2 NDST1-206ENST00000522491 777 ntTSL 222.34■■□□□ 1.177e-7■■■■■ 160.6
UTP3Q9NQZ2 NDST1-204ENST00000519157 576 ntTSL 520.97■□□□□ 0.957e-7■■■■■ 160.6
UTP3Q9NQZ2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.323e-14■■■■■ 160.5
UTP3Q9NQZ2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.684e-8■■■■■ 160.5
UTP3Q9NQZ2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.494e-8■■■■■ 160.5
UTP3Q9NQZ2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.474e-8■■■■■ 160.5
UTP3Q9NQZ2 WDR45-238ENST00000634939 574 ntTSL 519.31■□□□□ 0.684e-8■■■■■ 160.5
UTP3Q9NQZ2 WDR45-212ENST00000460501 861 ntTSL 319.31■□□□□ 0.684e-8■■■■■ 160.5
UTP3Q9NQZ2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.64e-8■■■■■ 160.5
UTP3Q9NQZ2 WDR45-231ENST00000634671 822 ntTSL 318.51■□□□□ 0.554e-8■■■■■ 160.5
UTP3Q9NQZ2 WDR45-235ENST00000634849 918 ntTSL 317.55■□□□□ 0.44e-8■■■■■ 160.5
UTP3Q9NQZ2 WDR45-237ENST00000634908 560 ntTSL 416.55■□□□□ 0.244e-8■■■■■ 160.5
UTP3Q9NQZ2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.174e-8■■■■■ 160.5
UTP3Q9NQZ2 SPRY4-201ENST00000344120 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.25e-7■■■■■ 160.5
UTP3Q9NQZ2 ZC3H14-211ENST00000555755 2529 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.64e-8■■■■■ 160.5
UTP3Q9NQZ2 ZC3H14-203ENST00000318308 1384 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.064e-8■■■■■ 160.5
UTP3Q9NQZ2 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.144e-8■■■■■ 160.5
UTP3Q9NQZ2 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.264e-8■■■■■ 160.5
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