Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms